即將於民國117年完工啟用的台南海水淡化廠，確定產水涵蓋工業和民生，引發輿論憂慮，市府18日發表聲明，指稱水利署保證產水將比自來水水質更好，可穩定臺南整體經濟發展的用水需求；市長黃偉哲強調，已爭取7億元中央經費，提升淡化廠周邊道路、綠地、觀光設施，以配合地方發展。

  水利局聲明表示，中央核定通過的「臺南海水淡化廠興建計畫環境影響說明書」，產出海淡水將將優先納入既有自來水系統，與既有自來水系統水量共同調配供給臺南地區民生及產業用水使用，並讓水庫水源減少出水量，俾利調蓄貯存於水庫內，以供枯水期間運用，達到供水穩定的目標。

  方一峰質詢指出，台灣目前共有24座海水淡化廠，大多集中在離島沒有水庫的地區，台灣本島有三座，都為工業用水，環評專家調查發現件將軍海淡廠預計興建點『懸浮固體濃度偏高』，海淡廠排放滷水濃度高達8度，濃度2度更造成養殖漁業很難生存。

  方一峰認為，希望中央寫下海水淡化品質保證的切結，也要長期監測滷水濃度，若未來滷水濃度影響漁民生計，就應賠償，漁民要轉業須請中央協助。

  他認為今年五月召開的說明會，會中沒提海淡廠的水要作為民生用水，但計畫在佳里區興建儲存用水的受水池，目前正在進行從將軍海淡廠到佳里受水池的拉管作業，大北門鄉親已於六月十四日組成自救會。

  水利局表示，依水利署評估，現行海水淡化技術、產水效率及能源回收效能日益精進，可大幅降低台灣本島供水不確定風險，中央自民國 100 年即開始規劃將軍海水淡化廠，全期每日產水規模為 20 萬噸，第一期工程產量每日 10 萬噸，目前辦理設計作業，預計 117 年完成第一期產水，未來海淡廠產水將透過輸水管線併入公共供水系統，由自來水公司統一調度供應做民生及產業用水使用。

  今年5月召開說明會時，地方民眾踴躍發言提出鹵水排放對漁業的影響、海淡水水質是否符合規定。水利署回應表示，海淡水經過嚴密生產流程水質符合標準，比自來水水質更好，鹵水經模擬排放與海水稀釋後鹽度無顯著增加影響輕微，於施工及運轉階段將加強環境監測不會影響漁民及漁業，並將持續加強與地方溝通說明。